Зброя періоду українського козацтва відрізнялася великою різноманітністю. У колекції МІЗ широко представлені клейноди - булави і перначі різних типів, бунчуки. Булави в той час були не тільки бойовою зброєю, а й символом влади великих воєначальників, гетьманів, кошових отаманів; перначі, зазвичай, були атрибутом командирів нижчих рангів, зокрема, полковників.
Широке поширення серед козаків мали сокири різних видів, а також клевціта чекани (укр. «келеп»). Останні використовувалися не тільки для пробивання обладунків ташолома, а і в якості статусної зброї командирів найнижчих ланок. Колекція МІЗ відрізняється різноманіттям сокир і клевців козацької доби.
Протягом ХVI-XVIII ст. козаки використовували різні типи як східних так і європейських шабель. Серед них - турецькі (пала, килидж), перські (шамшир), татарські (чечуга, ординка), шаблі угорсько-польського типу, карабела, гусарські шаблі. Велика кількість шабель козацької доби представленав експозиції МІЗ. Окремо серед клинкової зброї варто відзначити кончар (пол. «концеж») - допоміжну зброю польських гусарів з довгим прямим тригранним клинком колючого типу, призначену для колючих ударів із сідла у випадку поламки списа чи піки.
Масовоюзброєю в козацькому війську була різноманітна древкова зброя: піки та списи; сільськогосподарський інвентар, що трансформувався у зброю: гізарми (серпоподібні клинки на довгому держаку для стягування вершників з сідла і перерубування сухожиль на кінцівках коней), бойові коси (як звичайні, так і з додатково привареними і приклепаними до них сталевими шипами) тощо. Популярними були також кистені (обушки) і бойові ціпи. Є інформація про те, що козаки одними з перших в Європі стали застосовувати байонети (кинджал, який вставляється у ствол рушниці для ближнього бою, прообраз сучасного багнета). Такий козацький (імовірно) байонет знаходиться і в МІЗ. Разом з вогнепальною зброєю (рушницями, пістолетами) козаки використовували луки. Один з них (складний, турецького типу) представлений в експозиції МІЗ.
Зброя карпатського регіону в МІЗ представлена сокирами, клевцями і чеканами на довгих топорищах (бартками, валашками), які служили і інструментом, і зброєю, і знаком гідності, і деталлю одягу в Західній Україні тагірських районах Словаччини, Польщі, Чехії. В експозиції також є зброя західноукраїнських повстанців (бойові вила та ін.)
Представлена колекція з 139 експонатів найбільш яскраво відображає основні тенденції розвитку зброї періоду козацтва.
